В 50-е годы прошлого века в Дальневосточном университете создали учебный ботанический музей, но уже спустя десятилетие упразднили из-за нехватки помещений. Часть экспонатов удалось сохранить. В 1999 году они вошли в ботаническую экспозицию университетского музея. А уже в 2011 году на базе ботанической коллекции создали полноценный музей. Его площадь составляет 26, 4 квадратных метра. Здесь хранятся 138 видов растительных организмов и 11 монолитов почв Приморского края.
Посетители могут увидеть в основном дальневосточные виды растений – низшие и высшие. К первым относятся водоросли и лишайники, ко вторым – споровые, голосеменные и цветковые растения. Экспозиция располагает гербариями, фотографиями, спилами древесины, шишками и веточками.
Кроме того, в музее представлены редкие и охраняемые виды Дальнего Востока, имеющие ограниченный ареал.